Упаковка ионов в кальците несколько искаженная кубическая, т. е. весьма плотная. Внутри элементарной ячейки находятся две группы С03, состоящие из центрального атома С и трех атомов кислорода, расположенных в вершинах треугольника, плоскость которого перпендикулярна тройной оси. Расстояние С-О равно - 1,24 А. Два атома кальция лежат в вершинах и центре элементарной ячейки. В целом в решетке каждый ион (С03)2- окружен шестью ионами Са2+. В группе - ионе (С03)2- центральный ион (С4+ ) ковалентно связан с тремя ионами кислорода. При этом каждый ион кислорода получает 3Д заряда углерода. А если величина электростатической валентности связи между катионами и окружающими их ионами кислорода в комплексе больше единицы, то ионы кислорода прочнее связаны с центральным ионом в (С03)2-, чем с катионами Са2+, расположенными вокруг этого аниона. Комплексный ион (С03)2 очень прочен и не распадается ни при термическом разложении, ни при растворений соли.

Арагонит (Л-СаСОз) кристаллизуется в ромбической системе и отличается от кальцита лишь тем, что ионы Са2+ и (С03)2- в его решетке упакованы по принципу плотнейшей гексагональной кладки. Поэтому кристаллическая структура арагонита более плотна, чем у кальцита. Гексагональная кладка сказывается и на форме кристаллов. Часто она псевдогексагональная, призматическая или игольчатая. Арагонит образует двойники, тройники, радиально-лучистые (звездчатые) сростки и шаровидные зерна. Содержит примеси Sr (до 5,6%) Mg, Fe, Zn, но дает с ними не твердые растворы, только двойные соли. Отрицательный, двухосный с iVg = l,685 и Np = 1,530. В шлифе бесцветный. Удельный вес 2,9-3,0. Твердость 3,5-4,0. Арагонит представляет собой метастабильную фазу, постепенно переходящую при обычной температуре в кальцит. Арагонит характеризуется несколько большими твердостью, удельным весом и растворимостью в воде, чем кальцит. Однако отличить кальцит от арагонита в шлифе очень трудно.